このブログはRのBlogdownパッケージで記事を書いているが、一部のパッケージで結果がHTML上に表示されない場合があった。確認しているのはDiagrammeRとplotly。
　どうやら原因は親となるHTMLファイル(Rmdファイルのレンダリングしたhtml)のCSSによって、パッケージによる結果表示(htmlwidget)が影響を受けるというもの。その他dygraphなどでも同様の不具合があるらしい。 1.YihuiらのBlogdown解説サイト 2.Githubでの不具合報告

　この不具合の解決にはwidgetframeパッケージが有効。これはhtmlwidgetを引数として受け取り、親ファイルのcssの影響を受けない新しいhtmlwidgetを生成するというもの。 widgetframeパッケージの開発者のGithub

DiagrammeRの表示　

library(DiagrammeR)
library(widgetframe)
g <- grViz("digraph{graph[fontoname=Meiryo, rankdir=LR] 
           node[label='DiagrammeR']A 
           node[label='ウェブ上では非表示']B 
           node[label='DiagrammeR + frameWidget関数']C 
           node[label='ウェブ上で表示']D A->B C->D}" , height=200)
frameWidget(g)

plotlyの表示

library(tidyverse)
library(plotly)
data("anscombe")
p <- ggplot(anscombe, aes(x=x1,y=y1))+geom_point()+theme_bw()
ggplotly(p)